Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18533 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18533 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18533 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18533 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18533 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms