Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BlmO88700 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BlmO88700 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BlmO88700 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BlmO88700 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BlmO88700 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BlmO88700 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BlmO88700 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BlmO88700 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms