Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Sec22bO08547 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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