Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms