Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm2035J3QP87 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm2035J3QP87 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm2035J3QP87 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm2035J3QP87 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm2035J3QP87 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm2035J3QP87 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm2035J3QP87 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm2035J3QP87 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2035J3QP87 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms