Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms