Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm20830J3KML6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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