Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms