Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms