Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Syce3B5KM66 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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