Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Phf11bB4XVQ1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Phf11bB4XVQ1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms