Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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