Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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