Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PplQ9R269 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PplQ9R269 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms