Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnnt3Q9QZ47 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnt3Q9QZ47 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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