Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trim44Q9QXA7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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