Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefQ9JLC6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms