Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prg3Q9JL95 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prg3Q9JL95 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms