Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nectin1Q9JKF6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms