Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Slc38a3Q9DCP2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc38a3Q9DCP2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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