Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nop56Q9D6Z1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms