Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms