Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Snx20Q9D2Y5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms