Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms