Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkrip1Q9CWV6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkrip1Q9CWV6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms