Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW3

Mrpl54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl54Q9CPW3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl54Q9CPW3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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