Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms