Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms