Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms