Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp11Q99K46 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp11Q99K46 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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