Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ddb2Q99J79 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ddb2Q99J79 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ddb2Q99J79 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Ddb2Q99J79 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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