Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ctu1Q99J10 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms