Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nek8Q91ZR4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms