Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg8Q8VE18 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms