Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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