Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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