Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4aQ8C9S8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4aQ8C9S8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms