Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc113Q8C5T8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms