Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsfm13Q8BXS2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms