Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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