Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem87bQ8BKU8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms