Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim19Q80ZU4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms