Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NischQ80TM9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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