Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Rph3alQ768S4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rph3alQ768S4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rph3alQ768S4 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rph3alQ768S4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rph3alQ768S4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms