Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih3Q6ZWS4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih3Q6ZWS4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cnih3Q6ZWS4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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