Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms