Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Arhgap20Q6IFT4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms