Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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