Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms