Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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